癫痫外科手术通常给人的印象都是大面积开颅，跨越半球的长手术切口让人生畏，其实随着现代影像学及神经电生理学的发展，致痫灶的定位越来越准确，而神经外科手术设备的飞速进步，使神经导航、立体定向技术的广泛应用，使癫痫手术变得越来越微创，只需在头皮上作个两叁公分长的小切口，钻个小骨孔就可应用立体定向技术治疗。有下述情况可考虑用此方法治疗：
　　一、海马及杏仁核毁损术：海马和杏仁核均是引起癫痫放电的低阈值结构，癫痫发作的放大器，源于嗅脑某部分性的痫样放电，迅速呈弥漫性扩散至嗅脑和丘脑下部，海马毁损切断了嗅皮质至齿状回的重要传入途径，彻底破坏可产生癫痫放电的低阈值的结构，从而减少或抑制海马对边缘系统激动的促进作用，以提高癫痫发作的阈值。
　　二、胼胝体毁损术：胼胝体是两个大脑半球间传导的通路，毁损它可阻断和减弱两半球间的痫样放电向对侧大脑半球的传导，方法是在前联合前，每隔5mm，进行3~5次毁损，其有效率达89.5%，与开颅行胼胝体切开同样疗效，但创伤却小得多。对于药物难治性顽固性癫痫或伴有精神症状的癫痫有较好疗效。
　　三、Forel-H区的毁损术：Forel-H区又称红核前区，位于丘脑底部，由红核前区核和纤维组成。它是癫痫兴奋中心的必经之处，也是癫痫兴奋波传导纤维最集中的部位，故破坏此区可阻断癫痫放电的扩散途径，效果良好。